Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrimpolQ6P1E7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms