Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms