Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Szrd1Q6NXN1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms