Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Frem2Q6NVD0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms