Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mvb12bQ6KAU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mvb12bQ6KAU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms