Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggnbp1Q6K1E7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms