Protein–RNA interactions for Protein: Q6J1H4

Utf1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utf1Q6J1H4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utf1Q6J1H4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utf1Q6J1H4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms