Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm4Q6IRU2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm4Q6IRU2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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