Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms