Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rftn1Q6A0D4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rftn1Q6A0D4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms