Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep290Q6A078 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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