Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Jmjd1cQ69ZK6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1089.5 ms