Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prex1Q69ZK0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms