Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms