Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp4Q68FH0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp4Q68FH0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms