Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CltcQ68FD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms