Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms