Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arhgef39Q66JY6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arhgef39Q66JY6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms