Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc8eQ66JT1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms