Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Top2bQ64511 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms