Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PtprjQ64455 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PtprjQ64455 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprjQ64455 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprjQ64455 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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