Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms