Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Znf260Q62513 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms