Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lcn4Q62472 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lcn4Q62472 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Lcn4Q62472 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Lcn4Q62472 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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