Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CcncQ62447 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcncQ62447 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CcncQ62447 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms