Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zpr1Q62384 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Zpr1Q62384 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zpr1Q62384 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zpr1Q62384 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms