Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms