Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms