Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox19Q62249 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms