Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm5dQ62240 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms