Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp1Q62209 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sycp1Q62209 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms