Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.1 ms