Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Trim27Q62158 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Trim27Q62158 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Trim27Q62158 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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Trim27Q62158 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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