Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Prm3Q62100 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Prm3Q62100 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms