Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkciQ62074 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms