Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Odf1Q61999 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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