Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms