Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vsx2Q61412 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms