Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usf1Q61069 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usf1Q61069 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usf1Q61069 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usf1Q61069 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usf1Q61069 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usf1Q61069 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Usf1Q61069 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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