Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms