Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms