Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms