Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms