Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PmelQ60696 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms