Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgaeQ60677 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms