Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabl6Q5U3K5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms