Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms