Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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