Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RilpQ5ND29 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RilpQ5ND29 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms