Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nlrc3Q5DU56 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nlrc3Q5DU56 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nlrc3Q5DU56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms